在今年早些时候《战锤40K：暗潮》进行了进度系统革新之后，《战锤：末世鼠疫2》也进行了相应的调整。设计总监约阿基姆·塞特贝里在开发者博客中解释了这些变化的原因：随着对战模式的即将上线，Fatshark决定优化新玩家引导机制和升级系统，以更好地留住玩家。
为此，游戏放宽了一些难度限制。在私人游戏中，玩家可以与好友组队，不再受英雄力量的限制，方便使用高级角色带领新手。而在公共游戏中，老兵难度的英雄力量限制也被取消。塞特贝里表示：“对于熟悉类似游戏并寻求挑战的玩家来说，老兵难度是理想起点。”
此外，游戏在更高难度下提供额外经验值奖励，随着难度提升而增加。每高一级难度，经验值增加四分之一。早期版本曾有基于难度的经验值倍数，但在2019年的补丁中移除，提升至传奇难度水平。
在战利品方面，宝箱物品将基于获得时的等级，而非打开时的等级，这减少了囤积宝箱的需求。战利品稀有度不再与等级挂钩，玩家在高难度下提升宝箱等级可增加获得稀有物品的机会。解锁DLC武器后，也可在宝箱中发现这些武器。
物品制作系统也得到改进，升级成本调整为减少碎片需求但增加粉尘成本。转换更高稀有度粉尘为更低稀有度时，玩家将获得更多粉尘作为补偿。这些变化将通过难度选择屏幕和宝箱信息传达，帮助玩家了解物品力量范围和稀有度。
为改善新玩家的信息获取，游戏将推出新手手册，解释《战锤：末世鼠疫2》中隐藏的机制，使信息更易获取。
Fatshark计划在“今年秋季晚些时候”发布对战模式时同步推出进度系统重做。此外，年度万圣节活动也将上线，包括双倍经验值、新挑战、往年奖励回归及纳垢灵等内容。活动从10月31日持续至11月10日，为玩家带来丰富体验。
